建武九年（公元33年 癸巳年）
春天，正月，颍阳成侯祭遵在军中去世，刘秀下诏让冯异一并统领他的军队。祭遵这人，廉洁简约，做事小心，克己奉公，得到的赏赐都分给了士兵。他带兵纪律严明，所到之处，当地的官吏和百姓都感觉不到军队的侵扰。他选拔人才都用儒家的标准，喝酒作乐的时候，一定是高雅地唱歌、玩投壶游戏。临终前，他留下遗言要薄葬；别人问他家里的事，他始终没说什么。刘秀对他的去世格外悲痛，祭遵的灵柩运到河南时，刘秀穿着素服亲临吊唁，望着灵柩痛哭，十分哀伤。回宫途中，刘秀到城门前，看着运丧的车经过，眼泪止不住地流。丧礼结束后，刘秀又亲自用太牢的礼仪祭祀他。还下诏让大长秋、谒者、河南尹负责办理丧事，大司农提供费用。到下葬时，刘秀又亲临；安葬之后，还到他的坟前，慰问他的夫人和家人。之后朝会的时候，刘秀常常感叹说：“到哪儿能再找到像祭遵这样为国分忧、奉公守法的人呢！”卫尉铫期说：“陛下您太仁爱了，一直不停地哀悼祭遵，让群臣都感到又惭愧又敬畏。”刘秀这才不再提。
隗嚣又病又饿，只能吃干粮，又气又恨，最后去世了。王元、周宗拥立隗嚣的小儿子隗纯为王，聚集兵力据守冀县。公孙述派将领赵匡、田弇去帮助隗纯。刘秀派冯异去攻打他们。
公孙述派他的翼江王田戎、大司徒任满、南郡太守程泛率领几万人从江关出发，打败了冯骏等人的军队，接着攻下巫县以及夷道、夷陵，趁机占据荆门、虎牙。他们在长江上横着拉起浮桥、建起关楼，树立起木柱阻断水道，又在山上扎营，堵塞陆路，以此来抵挡汉军。
夏天，六月丙戌日，刘秀到缑氏县，登上轘辕山。
吴汉率领王常等四位将军，带着五万多人的兵力，在高柳攻打卢芳的将领贾览和闵堪；匈奴派兵救援，汉军作战不利。从这以后，匈奴势力越来越强盛，侵扰掠夺日益增多。刘秀下诏让朱祜驻军常山，王常驻军涿郡，破奸将军侯进驻军渔阳，任命讨虏将军王霸为上谷太守，来防备匈奴。
刘秀派来歙全面监督驻扎在长安的各位将领，太中大夫马援做他的副手。来歙上书说：“公孙述把陇西、天水当作屏障，所以才能多撑些日子。现在这两个郡要是平定了，公孙述也就没什么办法了。应该多挑选兵马，储备物资粮食。现在西州刚经历战乱，士兵百姓又疲惫又饥饿，如果用钱财粮食去招抚，他们的人就能够聚集起来。我知道国家需要供给的地方不止一处，费用可能不足，但这也是没办法的事啊！”刘秀觉得他说得对。于是下诏在汧县储备了六万斛粮食。秋天，八月，来歙率领冯异等五位将军到天水讨伐隗纯。