皇甫僎一行进入州衙，一幅来者不善的样子。苏轼吓懵了，不敢出来。祖无颇说，事已至此，躲不是办法，出去见见吧。苏轼完全乱了分寸，甚至不知穿什么衣服出来，祖无颇安慰道：“还没定罪呢，至多算嫌犯，还是穿官服吧！”
苏轼稳定心神穿好官服出来站在廊下，见皇甫僎身后两个兵卒腰间鼓鼓囊囊的，以为是刀剑，皇甫僎又故作神秘不说话，我们的苏大才子吓尿了，战战兢兢道：“我得罪朝廷，今天必定是来赐死，死就死吧，只希望跟家人告个别”。
皇甫僎这才吭声道：“不至如此。”等拿出公文一看，不过是普通的抓拿。很快，苏轼被押送京城，投送御史台监狱。交由御史台审讯。
审讯中，李定等人搜肠刮肚、翻箱倒柜、将苏轼的诗文审查了一个通遍，但凡有点嫌疑的，都摘录出来作为讽刺朝廷、嘲弄新法的证据，舒亶甚至指使御史摘录苏轼的诗句“世间唯有蛰龙知”，认为“龙”字是皇帝专用，苏轼用“蛰龙”是讽刺神宗。这样的举动连新法派的重臣章惇都看不下去了。
他愤怒地道：“自古以来称号中带'龙'很多，诸葛亮还绰号“卧龙”呢？难道他也是讽刺皇帝，真是舒亶吐了口唾沫，你们还将它当饭吃啊！”
在汉朝时，御史台办公的场所有许多柏树，栖息着数千乌鸦，人们便将御史台称为“乌台”。苏轼的案件主要由御史台操办，事后人们称这件冤案为“乌台诗案”。
最后李定他们将苏轼定罪判决，处以极刑，并列举了四项理由。
好在苏轼声望极大，朝中多人为苏轼求情，宰相吴充直言道：“陛下效法尧舜，以前曹操如此猜忌，犹容祢衡，陛下何不能容一苏轼？”
太皇太后曹氏也出面干预，对赵顼道：“前昔仁宗皇帝试策贤良回来，非常喜悦地说，朕今日为子孙得太平宰相两人'，就是指苏轼、苏辙兄弟！现在皇帝能杀他么？”
王安礼从容对赵祯道：“自古大度之主，不以言语治罪他人，如果杀了苏轼，恐怕后世议论陛下不能容人才！”