等到人族开始繁荣鼎盛，诸葛氏族便举族归隐不问世事。
千百年后，人族逐渐鼎盛，当初的天降异宝便是人族强盛之机。各类功法开始在人族中流传开来，一个个宗派也如雨后春笋般出现，一座座隶属于宗门的城市也应运而生，人族也有了与妖族抗衡的资本。
很快，因为功法差异、理念相悖，当然也少不了智慧妖类的推波助澜，人族开始长达百年的内乱，也衍生了所谓的正道与魔道，最后更是险些爆发了大规模的正魔之战。
就在正魔大战一触即发之际，诸葛氏族再现，随手掏出两件器物，便将隐匿在人族中的妖族细作揪出，巧妙的将人族之间的矛盾转化为人妖两族之间的生死大仇。而后，更是在诸葛氏族的带领下，开始了长达多年的‘杀妖除奸’行动。
直到妖族十王联手，强大的压力下，人族轰轰烈烈的灭妖行动才告一段落。也正是多年生死协同，人族正魔两道之间才渐渐放下多年仇怨，虽然还是相互排斥，但也不至于大打出手。此事过后，正魔两道各自组成联盟，诸葛一族再次归隐。
不过诸葛一族归隐之前又给正魔两盟各自送出一件奇宝，那便是明心宝鉴和清心圣玉。传闻，此二宝乃是诸葛氏族一对才华横溢的双胞胎耗尽毕生心血元所造。
明心宝鉴，可辨识善恶忠奸，被赐予正道联盟，防止奸佞宵小混入其中兴风作浪；魔道功法，修行极快，诡异无比，往往以生魂精血为修炼基粮，但是无论是人魂兽魂、人血兽血，其中都包含怨煞之气，因此越是修为高深的魔道修士，内心愈发黑暗，行为也愈发残暴，稍有不慎便会心神失守，化为只知道杀戮的怪物。而清心圣玉的出现，为魔道修士带来了无尽的福音，它能抑制人心黑暗，抚慰心神。因此，清心圣玉一问世，诸葛族人便将其赠予魔道联盟。
四千年前，剑宗第28代祖师掀起的惊天祸事，也是在诸葛氏族的努力下平息的。当时死在第28代祖师剑下的魔修不计其数，甚至不少魔修宗门甚至断了传承。虽说第28代祖师在众目睽睽之下受尽三业九劫而死，但魔修终究是魔修，生性暴戾、性情乖张的他们又怎么肯善罢甘休，一场浩浩荡荡的正魔大战即将展开。
当时的诸葛族人秘密联系正魔两道高层，强势镇压潜入人族多年的猿妖族主，也揭露了剑宗第28代祖师被蒙蔽多年的真相。原来猿妖族主觊觎天剑图录，伏杀剑宗第27代祖师，又布局多年，蒙蔽年幼的第28代祖师。
可怜第28代祖师终其一生都是妖族的棋子，最后更是受尽残酷的业劫而死，甚至到死都不知道真相。人族内战成功平息，不过作为始作俑者的猿妖一族成了人族正魔两道联手打击的首要泄愤对象，若不是有其他几个妖界大族照拂，那个世界的猿族早就被灭族了。也是那段时间，诸葛一族正式接受正魔两盟的邀请，成为人族势力最为强大的两大联盟的最高掌权人之一。
纵观古今，那个世界的人族只要到了生死存亡之际，总有天机一脉的身影出现。天生的聪明睿智是他们最强大的武器，他们那如天马行空般的创造力拯救了不计其数的人族同胞，镇妖锁、明心宝鉴、清心圣玉还有各式各样的各种功能的傀儡和阵法，甚至天机命理等法门也是一骑绝尘。但是他们又淡泊名利，总是在功成名就后悄悄隐去，从不贪恋权柄。即便是担任正魔两道联盟的最高掌权人，也从不滥用权力，只为联盟稳定和发展而呕心沥血。