为了找到由基拉内心阴影的根本原因，小智他们通过一根黑刺，来到了另一个世界。
“这里又是哪里呢?”小霞看着周围什么都没有的景象，不禁问道。
小智看着怀里的皮卡丘，“我想，这是由基拉还是蛋时的内心世界，应该是他出生前看到的景象。”
皮卡丘和波克比都变回原来的大小，忽然，一个巨大的黑色身影，出现在小智他们面前，这个黑色身影格外狰狞和扭曲，还伴随着机器的轰鸣声。
“小智，那是什么?”
然后，黑色装甲车身影，伸出一对机械手臂，朝着小智他们冲了过去，接着这些机械手臂，长出许多黑色触手，将小智一行人包裹在里面。
“好可怕，好可怕，好可怕....”
小霞听着这个地方，到处都是这个声音：“好害怕的样子。”和莎莉娜同时往小智方向靠了靠。
牢笼的外面，出现三个人类的身影，小智看着眼前的画面微微皱眉：“看样子，就是这三个家伙抓走的由基拉，见面时一定要送他们一拳！”
面前的场景不断在变化，一只班吉拉的身影出现在他们的眼前。
“妈妈…”很显然，那是由基拉的母亲。
作为一个母亲，孩子被盗走，班吉拉的愤怒可想而知，随后又无能的，被人类的炮火所吞噬，只能无力的哀嚎，即使是成年期的准神神奇宝贝，面对人类科技也只有无力。
随后他们看到，在炮火的覆盖下，班吉拉的身体出现一道裂缝。
由基拉不断呼喊着，但班吉拉也只能眼睁睁看着，三个坏人把自己的孩子抢走。
“MD，这群人渣，祈祷吧，别让我见到你们。”小智咬着牙愤怒的说。
“简直太可恶了，还对神奇宝贝使用武器。”就连平常喜怒不形于色的小刚，也是一脸愤恨。
“小智，绝对要让他们受到应有的惩罚！”小霞咬牙切齿的说道。
“小智，我们一定要阻止他们，宝可梦是会痛苦的生命。”莎莉娜的声音颤抖，但清晰，压抑着自己的愤怒。
“原来，由基拉之所以对人关闭心扉，是因为它和它的母亲，被这样无情的拆散了。”
直到现在，她们也理解，为什么由基拉，迟迟不能接受，除小智以外的人的原因。
“唰唰唰…”小智模仿奥特曼中的八分光轮，将波导凝练成型，直接切断这些这些黑色触手。
当黑色的牢笼消散之后，随之出现的，是远处的一点光亮，小智一行人赶紧跑了过去，他们发现，由基拉又变成刚开始那个样子，整个身体蜷缩在一起。
众人刚要靠近的时候，黑色的牢笼拔地而起，小智带着他们往后退，眼看着这黑色的牢笼不断攀升，变成由荆棘组成的高塔。