此时，基地核心的巨型发射塔开始蓄能，紫色球体的光芒愈发耀眼。白野知道，一旦发射完成，整个太阳系都将沦为基因改造的试验场。他与鲍里斯对视一眼，决定分头行动——老战士用剩余的量子坍缩弹吸引火力，白野则趁乱冲向发射塔。
在通往核心的通道里，白野遭遇了黑莲组织最后的精英部队。这些士兵身着能模拟周围环境的纳米战甲，手中的能量剑在真空里无声划过。白野凭借敏捷的身手与火铳的精准射击，艰难突破防线。当他终于抵达发射塔底部，却发现控制台需要双重验证——除了燕氏血脉，还需要初代先祖的生物特征。
千钧一发之际，鲍里斯的声音从通讯器传来：“接着！”一枚装着组织样本的试管从通道尽头滚来。原来老战士在战斗中从敌方指挥官身上获取了初代先祖克隆体的皮肤组织。白野将样本与自己的血液同时注入控制台，整个发射塔剧烈震颤，紫色球体的光芒开始不稳定地闪烁。
然而，初代先祖的全息投影突然出现。这一次，影像不再虚幻，而是由无数量子粒子凝聚而成的实体。“你以为这样就能终结一切？”先祖的声音冰冷如霜，“从千年前的基因实验开始，人类就注定要走向这条进化之路。”他挥动手臂，发射塔的自毁程序启动，同时月球表面开始出现裂缝——黑莲组织早已在月壳埋设了足以让月球解体的反物质炸弹。
白野冲向核心装置，试图逆转程序。鲍里斯的身影突然出现在他身后，将最后一枚量子坍缩弹固定在发射塔基座：“我来拖住他，你去解除炸弹！”不等白野反驳，老战士已冲向初代先祖，两人在紫色能量的漩涡中激烈搏斗。
当白野终于破解炸弹程序，发射塔开始剧烈爆炸。他拼命向逃生舱跑去，身后传来震耳欲聋的轰鸣。回头望去，鲍里斯与初代先祖的身影在能量风暴中渐渐消散。逃生舱升空的瞬间，白野看到月球背面腾起巨大的蘑菇云，那座罪恶的基地终于化为宇宙尘埃。
返回地球的途中，白野望着舷窗外寂静的星空。燕小蝶的徽章在胸前微微发烫，提醒着他这场持续多年的战争终于画上句号。但他知道，只要人类的欲望存在，类似黑莲组织的威胁就永远不会消失。而作为燕家最后的守护者，他将继续背负使命，在黑暗中守护着文明的火种。