“白野！东北象限的基因库撑不住了！”霍杰的嘶吼夹杂着爆炸声，“我和阿菱正在转移原始样本，但...”他的声音突然中断，通讯器里传来刺耳的电流声。
白野的指尖终于触碰到自毁程序的主控面板，却发现需要多重生物验证。他咬牙割破手掌，将鲜血按在扫描区，同时扯开领口露出燕家血脉特有的基因标记。当孤鹰与镜像的基因频率与系统产生共振时，倒计时戛然而止。
但货船的失控并未停止。白野冲向驾驶舱，发现船长早已变成一具被机械义肢包裹的尸体——正是清醒者的追随者。他强行接入手动操作系统，将货船转向无人区。橘子的声音突然传来：“干扰器已摧毁！电磁脉冲炮还能再发射一次！”
“瞄准货船的推进器！”白野握紧操纵杆，“把我们推离城市上空！”燃烧的货船在脉冲炮的轰击下剧烈震颤，白野感觉脊椎几乎要被过载的加速度压碎。当货船最终坠入太平洋时，基因诱变剂在海面炸开巨大的泡沫，在月光下泛着诡异的荧光。
白野挣扎着爬出残骸，漂浮在海面上。远处，极光号的探照灯刺破夜幕，霍杰的声音带着哭腔传来：“阿菱为了保护基因样本...她留在了地下基因库。”白野握紧残破的怀表，新的刻痕终于显现完整——那是展翅的孤鹰穿透基因链组成的风暴，下方刻着：“当黑暗吞噬一切，希望是最后的火种”。
三个月后，世界基因联盟特别法庭宣判秘书长终身监禁，其义眼内的神经控制装置成为“影子”组织渗透的铁证。白野站在阿菱的纪念碑前，手中捧着修复后的基因样本罐。橘子将一枚崭新的怀表递给他，表盖内侧刻着众人的合影，下方一行小字：“传奇的延续，是无数人用生命书写的答案”。
北极的冰原上，极光号再次启航。白野望着舷窗外的星空，破损的怀表与新表并排放在掌心。
他知道，“影子”组织仍在暗处蛰伏，但只要人类不放弃追寻真相的勇气，孤鹰的传奇就永远不会落幕。
而火星殖民基地的“深渊计划”，依然像悬在头顶的达摩克利斯之剑，等待着他们去破解。