戴金丝眼镜的男人脸色骤变：“你怎么可能......”他的话被突然启动的自毁程序警报打断。阿菱成功黑入核心系统，将所有纳米机器人的控制权反转：“这些小家伙现在听我的了！”她操控着纳米机器人在克隆体间穿梭，将它们分解成细碎的金属颗粒。
白野走向崩溃的男人，扯下他胸前的联合国徽章：“你以为戴上这个，就能掩盖基金会的罪行？”男人突然狂笑起来，机械义眼闪烁着疯狂的红光：“就算你毁掉这一切，世界早已千疮百孔！恐惧的种子一旦种下，就永远不会消失！”
“但希望的种子也不会。”白野举起怀表，表盖内侧浮现出新的刻痕，那是初代先祖与“影子”年轻时的合影，背后写着“以谎言终结谎言，以真相重塑未来”。他调出阿菱获取的最终数据，“你看，全球70%的基因污染已经清除，国际刑警正在逮捕基金会的残余势力。”
随着最后一个克隆体被瓦解，发射场的自毁倒计时只剩十秒。白野等人冲向逃生通道，在爆炸的火光中跃入雪地车。身后，曾经阴森的发射场被炸成废墟，漫天风雪迅速掩盖了所有痕迹。
三个月后，世界基因联盟成立，白野成为首席顾问。他将怀表捐赠给历史博物馆，表盖内侧刻着新的铭文：“血脉的传承，是用真相对抗黑暗的勇气。”在开馆仪式上，一个戴着兜帽的身影在人群中若隐若现，白野望向那个方向，嘴角微微上扬——他知道，战斗或许永远不会真正结束，但只要信念长存，孤鹰的传奇就会继续书写。
而在世界的某个角落，一台老式放映机正在运转，“影子”最后的影像仍在循环播放：“恐惧永不消亡......”但画面之外，白野父亲留下的字条被贴在墙面上，笔迹苍劲有力：“但人类的勇气，永远会比恐惧多一分。”