顶楼档案室门前，两尊机械守卫拦住去路。白野举起手枪射击，却发现子弹被能量护盾反弹。他迅速调整战术，将仅剩的两颗闪光弹投向守卫脚下。强光闪烁间，他抓住机会迅速，用军靴踢中机械守卫的关节部位，趁其动作停滞时，掏出从巴黎获得的基金会通行卡插入锁孔。
档案室大门缓缓开启，映入眼帘的是排列整齐的服务器机柜，中央的全息沙盘上，黑莲病毒的扩散路径正在疯狂闪烁。白野冲向主控终端，却发现需要虹膜和基因双重验证。他想起祖父日记里的线索，咬破手指将鲜血涂抹在虹膜识别器上，同时将掌心的疤痕按在基因验证区。
系统发出刺耳的警报声，白野的视线开始模糊，失血过多让他的意识逐渐涣散。但他仍死死盯着屏幕，看着病毒扩散程序的进度条缓慢倒退。“快成功了......”他喃喃自语，眼前却突然浮现出黄金面具人冷笑的脸。
“太晚了，燕双鹰。”黄金面具人不知何时出现在身后，手中的枪管抵在白野后脑勺，“你以为毁掉这里就能结束？黑莲病毒的真正核心，早已植入你的体内！”说着，他按下白野后颈的微型装置，白野顿时感觉体内有什么东西正在苏醒，剧烈的疼痛让他跪倒在地。
与此同时，古堡外传来震天动地的爆炸声。橘子和霍杰冲进档案室，却只看到白野倒在血泊中，黄金面具人早已消失不见。“白野！坚持住！”橘子撕开创可贴为他止血，霍杰则迅速将病毒程序的核心数据拷贝到硬盘。
白野在昏迷前，最后一眼看到的是全息沙盘上，那些代表黑莲病毒的红点虽然停止扩散，但他体内的黑暗力量却在不断翻涌。他知道，这场战斗远未结束，而他，可能即将成为自己最可怕的敌人......