次要剧情是部落方，被俘虏的奥格瑞姆从守卫森严的收容所内逃了出来，流亡中遇到了霜狼部落的酋长德雷克塔尔，并得到了杜隆坦唯一子嗣——萨尔的消息，之后他们开始一起共同营救那些被关押的兽人，之后流亡中的格罗姆·地狱咆哮带着战歌氏族加入，最后在解救敦霍尔德监狱兽人俘虏时遭到伏击，奥格瑞姆不幸战死，临死前将毁灭之锤传给萨尔，宣布其为新的部落大酋长。
【黑暗之门】之后，后续增加了几个新战役：
【上古之战】，剧情回到一万年前，艾泽拉斯第一次对抗燃烧军团的史诗战争，主角为玛法里奥·怒风、伊利丹·怒风以及泰兰德语风，游戏模式主要为RPG，大多数时候操控其中一位去杀敌完成任务。
【鲜血与荣耀】，主角是人类提里奥·弗丁与兽人老兵伊崔格，游戏模式是合作闯关，有不少潜行解谜的要素，这个战役地图解锁后，可以在多人模式中找寻队友两人一起玩。
【氏族之王】，萨尔成为部落大酋长之前的经历，这个难度较高，尤其是前期。
【恶魔之魂】，人类法师罗宁与红龙克拉苏斯联手解救红龙女王阿莱克丝塔萨，游戏模式和【鲜血与荣耀】一样是合作闯关，一样可以在多人模式里面邀请队友。
【巫妖王的诞生】，耐奥祖在德拉诺崩解后的奇妙冒险，最终在基尔加丹的调教下成为初代目巫妖王，控制诺森德的故事，这个模式也有大量的建造，需要控制亡灵大军征服一个个的诺森德本土种族势力，玩法偏策略。
再然后，便是大家最为熟知的【混乱之治】四个种族战役：
【兽族大逃亡】，原教程关卡，但药谦扩大了容量与剧情，丰富了很多的可玩要素，关卡也扩充到了五关。
【人族战役：洛丹伦的灾难】，洛丹伦王子、圣骑士阿尔萨斯的堕落与天灾军团的崛起。
【亡灵战役：诅咒者的崛起】，天灾军团的扩张与耐奥祖的阴谋。
【兽人战役：卡利姆多的远征】，萨尔带着兽人抵达卡利姆多，在新大陆建立新的部落，格罗姆牺牲自我击杀深渊领主，破除兽人血契，重拾兽人荣耀。
【暗夜精灵战役：永恒的结束】，剧情最为辉煌也最为宏大的战役，三族联军在海加尔山联手对抗燃烧军团，最终玛法里奥召唤远古之灵引爆世界树，消灭了燃烧军团的统帅阿克蒙德。