苏炎等人将各方收集到的线索进行整合与分析，逐渐拼凑出了一个惊人的真相轮廓。种种迹象表明，那个神秘组织极有可能是“宇宙仲裁者”中企图打破现有宇宙秩序、建立新规则的激进派。他们制造了时空装置，试图引入外部力量来实现自己的目的，而废弃星球上的古老神庙以及神秘晶体，或许是他们计划中的重要环节。
苏炎意识到，那块在神庙中发现的晶体可能蕴含着启动某种强大力量的关键信息。他与科学家们一起，运用最先进的技术和混沌之力，对晶体展开深入研究。经过无数次尝试，他们终于破解了晶体表面的一层能量封印，从中获取了一些古老的符文信息。通过与灵儿收集到的各种古老典籍进行比对，他们解读出这些符文指向了宇宙中的一个神秘地点——“星核之渊”。据说，“星核之渊”是宇宙诞生之初留下的神秘区域，蕴含着强大的原始力量，一旦被不当利用，足以重塑宇宙。
与此同时，蛟龙巨兽在废弃星球的进一步探索中，意外发现了关于五颗特殊灵力宝石的线索。在雕像的底座下，有一幅隐晦的地图，地图标记出了五颗宝石在宇宙中的大致位置。苏炎等人意识到，要阻止神秘组织的疯狂计划，就必须抢在他们之前找到这五颗宝石，稳定灵界与现实宇宙的灵力平衡，同时阻止他们获取“星核之渊”的力量。
神秘使者在灵界积极准备着稳定灵力平衡的仪式所需的一切。他与智者们日夜忙碌，布置各种灵界法阵，准备迎接五颗宝石的到来。神秘战士带领维和部队继续对神秘组织的残余势力展开清剿，不断削弱他们的力量，防止他们干扰苏炎等人寻找宝石的行动。
苏炎、灵儿和蛟龙巨兽兵分三路，根据地图线索寻找五颗宝石。苏炎前往一个被强大磁场环绕的星系，那里环境恶劣，强大的磁力干扰着一切电子设备和灵力运用。苏炎凭借混沌之力与坚韧的意志，在重重困难中寻找宝石的踪迹。终于，在星系核心的一颗巨大磁星内部，他发现了第一颗宝石——“磁力灵晶”，这颗宝石散发着幽蓝色的光芒，蕴含着强大的磁力灵力。
灵儿来到了一个充满奇幻色彩的星云，星云内充斥着各种奇异的灵力波动。在星云的深处，有一座漂浮的水晶宫殿。宫殿内机关重重，守护着第二颗宝石——“幻梦灵钻”。灵儿运用自己的智慧和灵韵笛的神奇力量，破解了一道道机关，成功获取了宝石。这颗宝石闪烁着五彩光芒，能够迷惑和操控人的心智，同时蕴含着强大的灵力稳定作用。
蛟龙巨兽则前往一个荒芜的星球，星球表面布满了火山和岩浆。在星球的地心深处，它与守护第三颗宝石“炎狱灵珠”的强大火灵展开激战。蛟龙巨兽施展出浑身解数，最终战胜火灵，拿到了散发着炽热光芒的炎狱灵珠，这颗珠子蕴含着无尽的火焰灵力。
在神秘战士清剿神秘组织残余势力的过程中，他们意外得知了另外两颗宝石的下落。原来，神秘组织已经找到了其中两颗宝石，正准备运往“星核之渊”。神秘战士立刻将消息传递给苏炎等人。苏炎等人迅速集结，在神秘组织运送宝石的途中设下埋伏。