“灵枢小心！” 素问甩出九根金针，布成 “九宫锁魔阵”，金针却在触及黑雾瞬间熔成铁水。灵枢七星剑斩向黑影，剑身上北斗纹与星针共鸣，爆发出刺目血光。黑影退避间，袖中掉落一张兽皮卷轴，卷轴展开竟是《黄帝内经》残页，却用朱砂批注着 “以人血饲针，以魂火锻器” 的邪术。
“你们以为改良针具就能救人？” 黑影发出金属摩擦般的怪笑，“当星针触地之时，便是青铜齿轮转动之日！” 他化作黑雾遁走，地面残留的黑液中浮现出朱厌的爪印，爪印中央躺着半块刻有 “天机匣” 字样的玉佩，与素问玉佩断裂处严丝合缝。
三日后，终南山腹地。素问带领弟子穿行在云雾缭绕的山林，脚下腐叶层中不时露出白骨残骸，空气中弥漫着硫磺与腐草的混合气息。弟子青禾突然指着前方惊呼：“师父，那是不是清瘴草？”
只见山坳阴湿处，几株三寸高的植物开着紫黑色花，花瓣形如鬼手，每片花瓣上都凝着水珠，在暮色中泛着诡异的幽光。素问刚要伸手采摘，却见草丛中突然窜出一只三足乌，鸟喙中叼着半片泛黄的帛书，帛书上用篆文写着：“清瘴草，食之可驱百毒，然需以生魂为引。”
“小心！” 素问话音未落，四周突然腾起黑色瘴气，瘴气中浮现出无数张痛苦扭曲的人脸，每张人脸都戴着与黑袍人相同的青铜面具。青禾瞳孔骤缩，惊呼：“这些人... 都是上个月失踪的药农！”
素问迅速捏碎随身携带的辟瘟香囊，香囊中飞出九只萤火虫大小的毕方鸟，火光所照之处，瘴气如冰雪消融。她趁机采摘清瘴草，却发现草根处缠绕着青铜齿轮状的根须，根须上还沾着新鲜的人血。“果然如古籍所言，清瘴草需以生魂培育。” 她将草收入药囊，指尖微微发颤，“看来那神秘势力，早已在深山设下祭坛。”
子时，医馆突现异象。
灵枢正在研磨清瘴草，石臼中突然腾起青色烟雾，烟雾中竟浮现出他父亲的面容。“枢儿，莫信... 齿轮...” 虚影刚开口，便被一阵阴风吹散。灵枢手中石杵 “当啷” 落地，目光落在桌上的星纹针上，只见针身星纹竟渗出暗红液体，在桌面上汇成 “勿启” 二字。