归零脉冲与混元守护结界的碰撞，在宇宙中掀起了一场足以颠覆所有认知的风暴。以「梦境与现实交织」为特色的「幻界宇宙」，天空开始崩塌，梦境与现实的边界彻底消失。人们白天行走在城市中，脚下却突然出现梦境中的深渊；夜晚入眠时，噩梦的怪物竟冲破意识，在现实世界大肆屠戮。城市在虚实交错的混乱中沦为废墟，居民们陷入了分不清梦境与现实的疯狂。
「元素平衡宇宙」则面临着元素暴走的灭顶之灾。地、水、火、风四大元素失去控制，火山喷发的岩浆与海水融合成毒雾，飓风裹挟着陨石撞击大地，地面突然裂开深渊将一切吞噬。元素使们的力量在混沌能量的冲击下彻底失控，有的化身暴走的元素巨兽，有的则被元素之力反噬，化作没有生命的元素结晶。
文明联盟的中枢系统在能量风暴中彻底损毁，最后的监测画面显示：混沌胚胎完全成熟，化作一个与宇宙等大的暗紫色球体，表面流转的纹路如同宇宙的血管，每一次搏动都在抽取各个宇宙的本源力量。不完美之种残留的意识在消散前，传递出最后的希望：「平衡...超越...融合...」
雷恩望着濒临崩溃的宇宙，做出了一个前所未有的决定——启动「文明火种计划」，同时召集所有觉醒者进行最后的决战。他将承载着全宇宙文明记忆与知识的「火种核心」发射向宇宙之外，为文明留下存续的可能。
幻界宇宙中，梦境守护者们联合现实世界的战士，共同对抗虚实交织的怪物。他们发现，唯有将梦境中的想象力与现实的行动力结合，才能创造出对抗混沌的武器。一位年轻的梦境画家在战斗中觉醒，他的画笔能将脑海中的想象具现化，绘制出的金色屏障暂时阻挡了噩梦怪物的进攻。
元素平衡宇宙里，残存的元素使们尝试重新建立元素共鸣。他们以自身为媒介，强行将暴走的元素力量引入「元素调和阵」。在调和的过程中，无数元素使被暴走的能量撕碎，但他们的牺牲让元素暴动的趋势得到了短暂遏制。