虚无回响的冲击余波未散，多元宇宙的时空结构开始出现不可逆的扭曲。在以「因果循环」维系文明的「轮回宇宙」中，生与死的界限彻底模糊。亡者的灵魂不再进入轮回，而是游荡在现世化为暗紫色的「虚无残魂」，所到之处，花草瞬间枯萎，金属急速锈蚀。新生的生命尚未诞生便被虚无侵蚀，成为畸形的混沌造物，整个宇宙的因果链条断裂，陷入无序的混乱循环。
「维度折叠宇宙」则遭遇了更为恐怖的灾难。暗紫色的虚无能量如同贪婪的巨口，不断吞噬着各个维度空间。曾经繁华的星际都市在维度折叠中被压缩成薄片，星球被撕裂成量子态的尘埃。维度行者们的导航仪彻底失效，他们在扭曲的空间中迷失方向，甚至有些行者的身体开始与不同维度发生重叠，痛苦地承受着空间撕裂的折磨。
文明联盟最后的监测中枢在超负荷运转中迸发出刺目电光，星图上暗紫色的螺旋纹路以惊人的速度扩散，将整个多元宇宙包裹其中。不完美之种遗留的核心程序在焚毁前，投射出绝望的画面：宇宙正沿着一条名为「终末」的轨迹螺旋下坠，尽头是绝对的虚无。雷恩凝视着逐渐破碎的监测屏幕，意识到这或许是文明最后的生死之战。
他迅速集结全宇宙仅剩的力量，启动「曙光逆转计划」。因果律学者莫妮卡带领团队奔赴轮回宇宙，他们携带的「因果修复罗盘」能短暂梳理断裂的因果链条，但在接近轮回核心「命轮圣殿」时，遭遇了由虚无残魂凝聚而成的「因果吞噬者」。这些怪物能随意改写因果关系，让攻击在发动前就已失效，防御在接触时就已瓦解。莫妮卡发现，唯有利用宇宙中尚存的「命运共鸣点」，才能打破这种因果悖论。
维度工程师维克多率领小队进入维度折叠宇宙，驾驶装备「空间锚定器」的「维度方舟号」战舰。他们试图重新稳定折叠的空间，却发现暗紫色能量会将任何稳定装置转化为折叠加速器。维克多在绝境中提出「逆向折叠」理论，利用空间的扭曲特性，将虚无能量引导至特定维度陷阱。
雷恩亲自带领精锐部队，直捣暗紫色螺旋的核心——一个被称为「虚无漩涡」的混沌区域。这里时间与空间失去意义，所有物质都在被分解成最原始的粒子。混沌原始意志的残识在此完全具象化，她化作一个由暗紫色能量构成的巨型漩涡，声音中充满宇宙终焉的苍凉：「雷恩，接受虚无的命运吧，这是所有文明无法逃避的终点！」