暗紫色晶体上的预言如重锤般砸在所有觉醒者心头，而宇宙的异变正以肉眼可见的速度加剧。在以「概率演算」构建文明的「熵算宇宙」，所有的概率模型突然失效。预测百年繁荣的星系瞬间因未知灾害化为废墟，本应万无一失的星际航线突现致命引力漩涡。科学家们惊恐地发现，暗紫色的混沌纹路正如同病毒般侵蚀着概率云，将确定的未来扭曲成无序的混沌。
同一时刻，「灵魂铸形宇宙」陷入更深的灾难。用于塑造灵魂形态的「铸魂熔炉」被暗紫色物质入侵，新生的灵魂刚一成型便扭曲成怪物，而成熟的灵魂则被抽离出负面情感，化作散播绝望的「噬魂者」。整个宇宙的灵魂共鸣网络沦为混沌的传声筒，不断播放着文明末日的幻象。
文明联盟的中枢系统响起刺耳的红色警报，量子望远镜捕捉到惊人画面：连接原初混沌海的裂缝处，暗红色光芒彻底凝聚成一只布满星云纹路的巨眼。它每一次开合，都在虚空中掀起足以撕裂空间的波纹，暗紫色的能量如血泪般滴落，所到之处的星体瞬间坍缩成黑洞。不完美之种最后的量子意识在湮灭前，传来一段混乱的波动：「眼瞳启封...万物归零...」
林夜紧急召开全宇宙文明会议，决定启动「终末防线计划」。小女孩带领科研团队争分夺秒改良「规则隔离罩」，将其升级为能抵御混沌规则侵蚀的「混元秩序盾」，但需要全宇宙文明的能量同步供应才能维持运转；洛璃则率领科技精锐前往熵算宇宙，试图用「概率锚定仪」重新稳定概率云，却在途中遭遇由混沌概率构成的「无序巨像」，这些巨像能将任何攻击转化为随机事件，时而让炮弹原路返回，时而让战舰陷入永无止境的时空循环。
苏瑶的灵能小队深入灵魂铸形宇宙的「铸魂圣殿」，发现混沌力量已将熔炉核心改造成「灵魂绞肉机」。队员们与噬魂者展开惨烈战斗，其中一名年轻的灵能者为保护同伴，主动引动自身灵魂之力自爆，以同归于尽的方式撕开防线缺口。苏瑶强忍悲痛，带领众人激活圣殿中的「灵魂共鸣阵」，将纯净的灵魂之力注入熔炉，暂时压制住混沌侵蚀。
林夜亲自率队前往虚空坟场，直面那只即将完全睁开的混沌之眼。觉醒者舰队刚进入战场，便遭遇「混沌凝视者」的阻拦。这些怪物由暗紫色能量与扭曲的时空构成，它们的目光所及之处，物质的分子结构会瞬间崩解。林夜挥舞新终焉之剑，斩出蕴含秩序法则的剑气，却发现攻击在接近混沌之眼时被其引力场吞噬。