混元维度枷锁的裂痕如蛛网般蔓延，宇宙各处的监测站接连捕捉到异常的量子波动。在以「梦境与现实交织」为特色的「幻渊宇宙」，人们的噩梦开始实体化，街道上漂浮着由恐惧凝结的暗紫色雾霭，巨型梦魇生物肆意破坏城市；而以「记忆铸型」为文明核心的「溯忆宇宙」中，集体记忆库被暗紫色病毒入侵，历史档案被篡改，英雄变成恶魔，胜利被篡写成惨败，民众陷入认知崩塌的混乱。
秦逸的平衡印记传来灼烧般的剧痛，印记表面浮现出与混沌本源晶核同源的纹路。他意识到，之前消失的晶核并非遁入虚无，而是渗透进了宇宙的「本源脉络」——那是连接所有宇宙规则与能量流动的隐形网络。更令人不安的是，各个宇宙的智者们通过占卜与演算，得出相同的恐怖结论：混沌本源晶核正在吸收宇宙中的负面能量，试图与原初混沌海建立完整连接。
觉醒者们紧急召开全宇宙文明议会，却在会议途中遭遇突袭。暗紫色的能量裂缝在会场空间中撕开，混沌原始意志的残识化作无数虚影，蛊惑在场的文明代表：「秩序不过是短暂的幻觉，唯有回归混沌，方能获得永恒的自由。」部分意志薄弱的代表被同化，当场发动攻击，议会大厅陷入混战。关键时刻，秦逸激活终焉之剑的秩序之力，金色光芒驱散虚影，但裂痕已悄然在文明内部种下。
为了追踪混沌本源晶核，觉醒者们分为四支精锐小队。小女孩带领科技文明的顶尖团队，驾驶装备了量子定位系统的「追迹者号」，在宇宙的暗物质流中寻找晶核踪迹。他们遭遇由暗物质与混沌能量融合的「虚无掠食者」，这些生物能隐身于虚空中，突然发动攻击吞噬舰船的能源系统。小队利用反物质诱饵制造能量脉冲，才得以暂时击退敌人。
在幻渊宇宙，由梦境守护者与灵能者组成的队伍深入「噩梦核心」。他们发现，混沌力量正在将人类最深层的恐惧编织成「现实锚点」，一旦完成，噩梦将彻底取代现实。队员们不得不直面自己内心最黑暗的记忆——有人看到挚爱之人的背叛，有人重温种族灭绝的惨剧。一位年轻的灵能者在恐惧中险些崩溃，却在同伴的呼唤下，将恐惧转化为净化力量，用温暖的回忆之光驱散了部分暗紫色雾霭。
溯忆宇宙的记忆修复者们则潜入集体记忆库的底层，与篡改历史的暗紫色病毒展开数据战。他们操纵着由文明记忆具象化的「历史之刃」，在数据流的战场中厮杀。但随着战斗推进，病毒竟开始学习他们的攻击模式，局势陷入胶着。最终，一位古老的记忆守护者献祭自身所有记忆，释放出「本源回溯之力」，将被篡改的档案恢复如初。