神国碎片如流星般坠向宇宙各个角落，三个月后，天鹰座星云中突然出现异常的能量漩涡。裂缝文明的深空观测站传回画面：暗紫色的雾气中，一座由扭曲晶体与流动熵能交织而成的巨型巢穴正在成型，其表面不断吞吐着破碎的恒星残骸与文明遗迹。不完美之种残留的监测节点在接触巢穴能量的瞬间，彻底熔解为数据流，仅发出最后警告：“混沌...正在孵化！”
秦逸的平衡印记泛起沸腾的熔岩纹路，他的意识被一股灼热的力量强行拽入巢穴内部。这里是一片充斥着嘶吼与尖叫的炼狱，无数被捕获的文明生物被改造成半机械半能量的畸变体，在暗紫色的粘稠液体中痛苦挣扎。熵寂意识化作巢穴顶端的巨型肉瘤，声音带着令人作呕的蠕动感：“秦逸，混沌熵巢...是熵寂的子宫。在这里，新的毁灭将诞生。”领域内投影出惊悚画面：机械文明的行星级战舰被腐蚀成血肉堡垒，修真文明的渡劫天雷被扭曲成孵化新怪物的能源。
觉醒者们意识到，巢穴正在利用吞噬的文明资源孕育更恐怖的存在。他们启用初代神农遗留的“净化圣枪”，这件由宇宙初始纯净能量锻造的武器，需凝聚全宇宙文明的希望与净化之力才能发挥真正威力。众人驾驶经过生物能与能量护盾双重强化的“清剿号”战舰，突破巢穴外围的腐蚀性雾气，却遭遇“熵巢守卫者”的阻拦。这些怪物形态怪诞且能力诡异：有的是能将攻击转化为血肉增生的“血肉使徒”，伤口处不断长出新的肢体；有的是操控腐蚀能量的“熵液领主”，所到之处，金属汽化、灵脉枯竭。
“它们的弱点在核心能量器官！”小女孩将机械心脏与全宇宙文明的生命信号网络相连，启动“生命共振净化场”。金色的净化光芒与暗紫色的腐蚀能量碰撞，产生的能量风暴暂时抑制了守卫者的再生能力。秦逸抓住机会，挥动净化圣枪，刺出“逆命净世突刺”，枪尖上的平衡印记迸发净化之力，贯穿了几只守卫者的要害。
清剿号深入巢穴核心，一座由暗紫色血肉与晶体混合构筑的“熵寂孵化囊”悬浮在沸腾的能量池中央。孵化囊表面凸起无数跳动的瘤状组织，每个组织都包裹着散发着邪恶气息的胚胎。熵寂意识发出令人牙酸的尖笑：“当孵化完成，这些孩子...会让整个宇宙哀嚎！”孵化囊突然释放“终焉腐化浪潮”，暗紫色的液体与能量混合体奔涌而出，所到之处，战舰的装甲被腐蚀出蜂窝状孔洞，船员们的身体开始出现血肉变异症状。
千钧一发之际，秦逸引导全宇宙文明对纯净的向往、对新生的渴望，将共生之力注入净化圣枪。圣枪爆发出万丈光芒，在虚空中凝聚成“永恒净化屏障”。“腐化终将被净化！”秦逸将全宇宙文明的净化智慧、初代神农的创世纯净之力，以及不完美之种残留的生机融合，发动“逆命混沌涤荡”。
璀璨的光芒如洪流般冲击孵化囊，整个巢穴剧烈震颤。熵寂意识发出绝望的嘶吼，孵化囊开始崩解。但在毁灭前，孵化囊内的胚胎化作无数暗紫色的“混沌熵卵”，通过空间裂隙四散逃离。秦逸望着逐渐坍塌的巢穴，深知这场战斗只是开始——每一颗混沌熵卵都可能在未来某个角落孵化出足以毁灭文明的怪物，而守护宇宙的征途，永远没有终点。