混沌种子如瘟疫般散布宇宙，所到之处，空间法则开始出现诡异扭曲。机械文明的精密仪器自动拆解重组为混沌图腾，魔法世界的元素精灵陷入自相残杀的狂乱，就连最原始的部落也开始崇拜起散发着腐臭气息的混沌祭坛。万界医盟的“明心灯塔”在混沌侵蚀下接连熄灭，最后一座灯塔在崩塌前，投射出一张由暗紫色纹路编织的星图，直指宇宙核心区域的“秩序之源”。
林婉的《万界医典》彻底失去光芒，化作一团不断变幻形态的混沌光团，内部隐约传来远古魔神的嘶吼。光团表面浮现出一行行不断湮灭又重生的文字：“当秩序根基动摇，混沌即为真理；一切修复，皆是虚妄的拖延。”秦逸的神农血脉与混沌种子产生共鸣，每一次心跳都伴随着剧痛，他的皮肤上逐渐浮现出与混沌图腾同源的纹路，仿佛正在被改写成混沌的容器。
两人带领精锐小队深入宇宙核心，却发现“秩序之源”已被一层暗紫色的混沌膜包裹。这层膜如同活物般蠕动，将所有靠近的能量转化为混沌之力。小队成员刚发动攻击，手中的武器便扭曲成尖锐的骨刺，指向自己的同伴。“这不是单纯的力量对抗。”秦逸强撑着意识，“混沌正在利用我们对秩序的执念，将攻击反弹回自身。”
就在局势陷入绝境时，秦天明的残魂突然爆发出耀眼光芒，在混沌膜上灼烧出一道细小的裂缝：“进入秩序之源的核心，那里藏着...对抗混沌的最终答案...”裂缝中涌出的并非秩序之力，而是一种介于混沌与秩序之间的“原初能量”，这种能量既包含着毁灭一切的狂乱，又蕴含着创造万物的生机。
林婉咬破舌尖，将精血融入原初能量，试图解析其本质。她的意识瞬间被卷入一场跨越时空的幻象：在宇宙诞生之初，混沌与秩序本为一体，是生命的出现打破了这种平衡，导致两者不断对抗。“我们一直都错了。”林婉从幻象中惊醒，“混沌与秩序并非对立，而是需要重新融合！”
秦逸与林婉将融合法器彻底拆解，与《万界医典》的混沌光团、原初能量融为一体，创造出全新的“混元法器”。法器表面流转着黑白交织的纹路，象征着混沌与秩序的共存。他们带领小队成员组成“混元大阵”，以法器为引，强行将混沌膜撕开一道巨大的裂口。