11日各路日军均退返信阳地区，恢复战前状态。豫南作战至此结束。此役，共毙伤日军余人。
豫南会战以侵华日军失败中国军队胜利而告结束。有力地打击了侵华日军的嚣张气焰。豫南会战的胜利，是国军正面战场难得的一次顺利，第五战区司令长官李宗仁声望大增，这是他继台儿庄大捷之后的又一次胜利。
战后，李宗仁专门致电延安总部、新四军军部表达感谢之意。对于新四军在大别山、八路军在铜柏山也采取了默认的态度。
而此时的山东根据也发生了一件大事，滨海军区独立营朱信斋部发生叛乱，过年期间，滨海军区社会部截获了朱信斋的叛逃的密信。
得到确切的证据后，滨海军区采取了断然措施，带部队包围了朱信斋部，朱信斋意图反抗被军中共党员制服，朱信斋部被缴械。
陈司令请示沂蒙军区如何处置，沂蒙军区产生激烈的争论，有人主张杀一敬百，有人认为不可草率，毕竟是未遂，担心对以后收缩地方武装产生影响。最后上报到军部、延安总部。朱信斋这事有些特殊，他投靠的是国党，不是日本人。现在是国共合作期间，很难以叛乱罪论处，虽然他信中有处置军中共产党之意，但未遂。延安总部来电给出指导意见，交由沂蒙军区军事法庭审判。军事法庭经过激烈的辩论，判处朱信斋及其同伙3一8年有期徒刑。
山东沈鸿烈抗议沂蒙军区破坏抗日统一战线。沂蒙军区表示审判朱信斋有罪，并不是因为他要脱离我军加入国军，而是因为朱信斋意图谋杀军中共产党，犯了谋杀罪。并拿出朱信斋的亲笔密信，指出朱信斋要断然处置军中共产党是这一段，堵住了沈鸿烈的嘴，沈鸿烈只能怪朱信斋行事不密，加上沂蒙军区实力雄厚沈鸿烈也无可奈何。至此这一事件慢慢落下帷幕。
滨海军区对原朱信斋部进行了全面接管改造。最后撤销其独立营编制，人员经甄别改造后分散并入其它部队之中。
山东军政委员会还就此事专门发文到各根据地，要求各根据地要以此事为戒，加强对此类独立地方武装的管理，降低其独立性。要求各根据地增派政工人员到此类独立地方武装，对部队进行思想改造，同时派出正规部队与其进行混编，消除此类隐患。