到了癸卯年秋分，玄真觉得此草火候已足。按“秋收”之律，他选了个露水未干的清晨，用竹刀小心刨出完整根须，那根竟有尺许长，形似小人参，却更显清透。他将根须阴干，断面呈黄白色，闻之有淡淡药香，嚼之甘润无渣。“当入肺、胃二经，”玄真在药经上批注，“甘平补阴，苦能泄热，可清上焦虚火，益目窍精气。”此时他还不知，这株被他称作“云顶沙参”的灵草，将在数年后，被皇家烙上金印。
第二卷：眼疾横行扰乡邻，仙根初试显神效
甲辰年春，金堂一带忽降怪雨，雨水中带着硫磺气，落在草木上，叶片便生黄斑。没过半月，乡邻们纷纷眼生红翳，轻则视物模糊，重则如蒙纱帐，便是孩童也揉着眼睛哭喊“看不清阿妈针线”。县中郎中用菊花、桑叶煎汤，初时有效，后来竟越洗越肿，皆因那雨属“湿热疫气”，常规清火药已难解其毒。
一日，山下有个叫狗剩的少年，双眼肿得如桃，父母抱着他跪在慈云寺山门外，哭求玄真救命。玄真掀开少年眼皮，见白睛布满赤丝，黑睛上蒙着一层灰翳，按脉则浮数而滑，正是“湿热郁于肝经，上攻于目”之证。他想起那云顶沙参，心一横：“且试试这新药。”
他取来三钱干参，配伍车前子（利水去湿）、夏枯草（清肝泻火），又加了少许蜂蜜调和苦味，煎汤让少年温服。按“君臣佐使”之理，沙参为君，补阴而不滞湿；夏枯草为臣，助其清肝火；车前子为佐，引湿热从下焦而去；蜂蜜为使，调和诸药。三剂下去，少年红肿渐消，能看清寺前的石狮子了。
又有个张老秀才，读了一辈子书，双眼早已昏花，此番被疫气所侵，竟连灯烛都看成一团黑影。玄真诊其脉，沉细而弱，知是肝肾阴虚，兼夹湿热。便在沙参之外，加了熟地（补肾阴）、山茱萸（养肝血），这三味药同用，正是“滋水涵木”之法——肾属水，肝属木，水生木，补肝肾之阴，方能濡养目窍。七剂药后，老秀才竟能看清蝇头小楷，他摸着书页叹道：“这药竟比我吃了十年的枸杞还灵！”
消息传开，求药者踏破慈云寺门槛。玄真按“辨证施治”之法，对湿热重者多加茵陈，对阴虚甚者添些麦冬，对气郁者少佐薄荷。他发现此药最奇处，是能“引诸药入目窍”，仿佛有灵性般，直趋病所。山下药农见此草神效，也学着玄真的法子，在云顶山向阳处栽种，只是寻常地块长出来的，根须短而味淡，药效竟差了三成。玄真道：“此草得云顶山‘石气’与‘云气’相济，离了这方水土，便失了灵性，正如人离了天地清气，难养精神。”