在凯撒的支持下，安东尼被任命为“鸟占祭司学院”（College of Augurs）成员，这是一个负责通过研究鸟类飞行来解读神意的重要祭司职位。
所有公共行为都需要吉兆，这使该学院具有相当大的影响力。
随后，安东尼在公元前49年当选为十位护民官之一。
在这一职位上，安东尼可以通过否决不利于凯撒的行动来保护他的恩主。
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凯撒与庞培之间的冲突在公元前49年初爆发为公开对抗。
当年的执政官盖乌斯·克劳狄乌斯·马尔凯卢斯（Gaius Claudius Marcellus）和卢修斯·科尔内利乌斯·伦图卢斯·克鲁斯（Lucius Cornelius Lentulus Crus）反对凯撒。
当时庞培虽身处罗马，却担任西班牙（Spain）总督并指挥着数支军团。
在整个公元前50年，凯撒与元老院之间进行着不安的谈判，凯撒要求在身居军职的情况下获得竞选执政官的权利。
安东尼再次提出小库里奥（Curio）的提案，建议凯撒和庞培同时放弃指挥权，恢复为平民身份。
这一提案受到大多数元老院议员的欢迎，但执政官和卡托（Cato）坚决反对。
随后，安东尼提出新建议：凯撒保留八个军团中的两个以及伊利里亚（Illyrium）总督职位，同时允许其以缺席方式竞选执政官。
尽管庞培对这一让步表示满意，但卡托和伦图卢斯拒绝妥协。
安东尼声称自己性命堪忧，逃离罗马返回凯撒在阿尔卑斯高卢（Cisalpine Gaul）的营地。
安东尼离开后几天，即公元前49年1月7日，元老院再次开会。
在卡托的领导下，并得到庞培的默许，元老院通过了最终议决（senatus consultum ultimum），剥夺凯撒的指挥权，并命令他返回罗马接受审判。
元老院还宣布，若凯撒不立即解散军队，他将被视为国家公敌。
随着和平解决的希望破灭，凯撒以安东尼为借口向罗马进军。