自此以后朱棣和朱允炆攻守异形。
为了稳步推进南下，朱棣开始围攻济南。
但是朱棣的大军遇到了铁铉和盛庸这两个既有军事才能又誓死守城的硬茬子。
水淹、炮轰、挖地道都无法有效破城。
其中朱棣要架炮攻城时，铁铉神之一手，居然将朱元璋的牌位挂满了城头，使得朱棣忌惮毁坏老爹威严的影响会让自己失去“清君侧”的法理，从而不敢开炮攻城。
最终长期作战不利使得士兵们厌战情绪渐生，朱棣不得已只能无奈撤军。
铁铉与盛庸作为守城方还不肯罢休，又整军追击收复德州等失地。
就因为铁铉和盛庸这两个人，让朱棣失去了最佳的南下战机，中央军恢复过来又重整兵马大举反攻。
使得两年来朱棣打下的许多地盘又被中央军收复了回去。
朱棣痛定思痛，不再执着于攻下济南，决定直接进攻南京以消灭中央军有生力量为主，避开攻城战的不利因素。
于是只用少数兵力作为牵制后方避免腹背受敌，自己则率领大军寻找中央军主力进行决战。
公元1402年，朱棣在夹河、藁城击败盛庸，遇到徐州守军坚守不出时，也选择直接绕过继续南下。
当朱棣大军逼近南京时，朱允炆为了争取时间整顿兵马，于是主动与朱棣议和，愿以割地为条件进行停战议和。
朱棣自然能看出这是缓兵之计并未同意。
同年十二月，朱棣得知京师金陵防御空虚，遂举兵南下，在灵璧遇到中央军主力。
双方进行多日决战，最终因为粮道被朱棣截断，中央军遭遇大败几乎全军覆没。
消灭了主力军后，朱棣再也没有遭遇像样的抵抗，一路顺利南下，接连攻克泗州、盱眙、扬州，最终直指金陵。
到达金陵后，之前就给朱棣送过“大礼”的李景隆此次又给朱棣送上了大礼。
作为京城守将的他，居然直接选择投降，将偌大的京城直接拱手交给了朱棣。
可见一将无能，累及三军的名言是多么深刻的至理。
不幸的是大明朝由这等爵位继承制下诞生的平庸之辈统帅大军，幸运的是这样的人不在朱棣这一边。
有说法认为李景隆与朱棣有秘密交易，因为朱棣夺取皇位成功后，将他定为了靖难第一功臣，保留曹国公爵位，还加封为太子太师。
但是仅仅两年后朱棣就废了他的爵位，还将他软禁加家中，抄没了家财。