整个阿拉弗拉海域略微呈现出东西方向延伸，其东北侧的伊里安岛南海岸属于平原海岸，海岸线平直，海岸边分布着许多沼泽。其西南侧的澳大利亚海岸也是平原海岸，海岸边也广泛分布着沼泽，并且海岸线非常曲折，分布有许多海湾。主要海湾有芒特诺里斯湾、布科湾、白金汉湾、阿纳姆湾和梅尔维尔湾等。该海洋四周陆地流入海洋中的河流全部河水长度都很短。
在地质方面上，整个海域位于大陆架上，海水深度不大。南部岸边分布有广阔的浅滩，海水深度浅于50米，一般宽度为50~160千米；并且在浅滩里还分布着许多珊瑚礁。而在北部边界还分布着四处呈现东西方向排列的暗礁和浅滩。另外，在韦塞尔群岛中的马钦巴岛北端向西北方向排列又分布有9处45~124米的浅水区；而在其他地方一般的海水深度基本都是在180米以内，海底向西边倾斜，大部分海水深度超过了180米，东部最浅处海水只有8米深。西北部有一片深于200米的海域，阿鲁姆槽最深处是3680米，深槽再向西延伸就成为印度洋中的爪哇海沟。
阿拉弗拉海域在气候方面上，由于海域大部分在南纬10°附近，故而属于热带气候，高温潮湿。又由于位处于热带地区，阿拉弗拉海又是热带气旋的孕育地。
阿拉弗拉海洋的水文特征是海面水温在25~28℃之间，海水盐度在34~35%左右。冬季盛行偏东风，夏季风向多变。阿拉弗拉海的海流受盛行风作用时有季节变化。冬季盛行偏东风，表层海流向西流；夏季风向多…
在南纬8°以北，表面海流不明显。在南纬8°以南，海流在冬季向西边流，而在夏季则是方向不定。这片海洋里的托雷斯海峡是一条有名的危险航道，在阿拉弗拉海中分布有许多没有经过测绘和标明的险滩。阿鲁岛沿海水质洁净，风平浪静，产珍珠，产量虽不高却持续稳产。